130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001630 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  100 
 
 
582 aa  1202    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  55.42 
 
 
605 aa  670    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  68.22 
 
 
586 aa  826    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.95 
 
 
597 aa  679    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  87.56 
 
 
587 aa  1050    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  56.06 
 
 
590 aa  664    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  41.68 
 
 
607 aa  432  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.64 
 
 
626 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.01 
 
 
613 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.63 
 
 
636 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.07 
 
 
662 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.25 
 
 
600 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.81 
 
 
616 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.73 
 
 
583 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  34.75 
 
 
605 aa  340  5.9999999999999996e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.96 
 
 
611 aa  339  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  35.97 
 
 
591 aa  336  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.45 
 
 
584 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.72 
 
 
576 aa  267  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.65 
 
 
571 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.72 
 
 
591 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.37 
 
 
568 aa  260  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.91 
 
 
569 aa  259  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  32.04 
 
 
571 aa  257  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.93 
 
 
629 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.06 
 
 
569 aa  249  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.93 
 
 
624 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.93 
 
 
629 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.65 
 
 
571 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  30.9 
 
 
583 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  30.33 
 
 
619 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.83 
 
 
638 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.83 
 
 
638 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.83 
 
 
633 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
571 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.65 
 
 
638 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.21 
 
 
568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.37 
 
 
630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  31.26 
 
 
586 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.12 
 
 
573 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.5 
 
 
570 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.24 
 
 
605 aa  230  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.76 
 
 
571 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.84 
 
 
579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  28.89 
 
 
292 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  31.45 
 
 
295 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  29.26 
 
 
324 aa  118  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.54 
 
 
313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.56 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  31.58 
 
 
317 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  30.35 
 
 
309 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
303 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.1 
 
 
294 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.26 
 
 
303 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.84 
 
 
313 aa  100  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.21 
 
 
304 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  28.24 
 
 
311 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.13 
 
 
316 aa  91.3  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.7 
 
 
316 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.02 
 
 
281 aa  87.4  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.41 
 
 
283 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.87 
 
 
304 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0467  hypothetical protein  23.84 
 
 
313 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0419567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  25.54 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  25.82 
 
 
275 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  34.51 
 
 
258 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  26.75 
 
 
271 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.26 
 
 
253 aa  57  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  26.74 
 
 
307 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  28.52 
 
 
268 aa  57  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  27.48 
 
 
271 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.26 
 
 
266 aa  57  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.23 
 
 
270 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.81 
 
 
265 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  28.16 
 
 
272 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  28.16 
 
 
272 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  28.16 
 
 
272 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.68 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  28.68 
 
 
268 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2305  hypothetical protein  25.74 
 
 
286 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.050145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  28.16 
 
 
250 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  28.16 
 
 
250 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  28.16 
 
 
250 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  27.15 
 
 
288 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  28.16 
 
 
301 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  27.72 
 
 
338 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  28.68 
 
 
268 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  28.68 
 
 
270 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  32.52 
 
 
287 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  28.82 
 
 
255 aa  54.3  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.07 
 
 
283 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  27.47 
 
 
268 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  27.47 
 
 
268 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.87 
 
 
249 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  24.77 
 
 
266 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  27.23 
 
 
278 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1900  hypothetical protein  27.14 
 
 
271 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  24.81 
 
 
258 aa  50.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.57 
 
 
331 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  24.89 
 
 
280 aa  50.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>