67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2932 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.27 
 
 		 316 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  79.93 
 
 		 316 aa  507  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  56.99 
 
 		 304 aa  328  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.73 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.35 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.22 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.85 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.55 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.57 
 
 		 611 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.15 
 
 		 600 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  34.33 
 
 		 605 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  28.15 
 
 		 590 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.97 
 
 		 569 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.63 
 
 		 573 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  26.29 
 
 		 571 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.98 
 
 		 569 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.52 
 
 		 576 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.98 
 
 		 568 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.82 
 
 		 571 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.48 
 
 		 591 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.27 
 
 		 568 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.45 
 
 		 638 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  24.6 
 
 		 619 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.6 
 
 		 629 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.6 
 
 		 629 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.09 
 
 		 638 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.09 
 
 		 638 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.21 
 
 		 624 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.09 
 
 		 633 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.81 
 
 		 630 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 		 636 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  29.29 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  27.22 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.05 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.44 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  28.42 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.44 
 
 		 571 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  22.94 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  28.64 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  27.87 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.32 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.27 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  26.32 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.26 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.5 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.08 
 
 		 570 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.36 
 
 		 605 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  28.49 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  26.92 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  26 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.87 
 
 		 583 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.35 
 
 		 616 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.98 
 
 		 626 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.93 
 
 		 613 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  25.63 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.52 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  24.63 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  23.79 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  25.79 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  24.47 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 		 1185 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.4 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2101  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.84 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.93 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.32 
 
 		 1114 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09120  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.63 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>