136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0590 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  60.48 
 
 
590 aa  712    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1253    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  54.64 
 
 
586 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.64 
 
 
597 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  55.08 
 
 
587 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  55.42 
 
 
582 aa  670    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  40.46 
 
 
607 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.17 
 
 
626 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.47 
 
 
613 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.25 
 
 
583 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.57 
 
 
616 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.78 
 
 
662 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.59 
 
 
636 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  34.21 
 
 
605 aa  355  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.12 
 
 
600 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
611 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  33.99 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
584 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.27 
 
 
571 aa  276  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.41 
 
 
568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.72 
 
 
569 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 
576 aa  273  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.26 
 
 
569 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.22 
 
 
638 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.05 
 
 
579 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.66 
 
 
568 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  33.09 
 
 
586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.91 
 
 
571 aa  267  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.1 
 
 
633 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.35 
 
 
591 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  32.66 
 
 
571 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 
638 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.36 
 
 
638 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  32.42 
 
 
619 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.62 
 
 
630 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.52 
 
 
571 aa  260  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.23 
 
 
629 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.23 
 
 
629 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.23 
 
 
624 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.87 
 
 
605 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.28 
 
 
573 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  30.73 
 
 
583 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.4 
 
 
570 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.03 
 
 
571 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.23 
 
 
313 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  32.67 
 
 
292 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  34.07 
 
 
295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.15 
 
 
292 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  32.75 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  30.7 
 
 
317 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  30.61 
 
 
309 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.11 
 
 
283 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.15 
 
 
313 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  28.43 
 
 
324 aa  104  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.8 
 
 
303 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.34 
 
 
294 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.88 
 
 
303 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.91 
 
 
304 aa  99.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.06 
 
 
316 aa  90.5  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.38 
 
 
316 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.29 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  27.71 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  25.56 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0467  hypothetical protein  23.36 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0419567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.14 
 
 
281 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  36.52 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.13 
 
 
635 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.55 
 
 
618 aa  57.4  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.62 
 
 
635 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  25.42 
 
 
271 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.71 
 
 
317 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.25 
 
 
632 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.86 
 
 
331 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  32.61 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2719  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  25.11 
 
 
267 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
620 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
620 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
620 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0687  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.45 
 
 
242 aa  53.9  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  25.87 
 
 
635 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.59 
 
 
637 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.43 
 
 
620 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09120  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  22.75 
 
 
256 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  28.35 
 
 
255 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.77 
 
 
277 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.938758  normal  0.157607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  22.58 
 
 
645 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  24.45 
 
 
257 aa  50.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.88 
 
 
621 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  37.27 
 
 
250 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.81 
 
 
266 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.25 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.62 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.62 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.62 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  31.78 
 
 
283 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.86 
 
 
620 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0432  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.84 
 
 
212 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0360241  hitchhiker  0.00110988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0469  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.12 
 
 
249 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00940053  normal  0.968751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
620 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
620 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>