169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1073 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 571 aa  1182    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.37 
 
 		 571 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.4 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  44.82 
 
 		 619 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.91 
 
 		 638 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.21 
 
 		 629 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.39 
 
 		 629 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.56 
 
 		 624 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.56 
 
 		 633 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.74 
 
 		 638 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.99 
 
 		 630 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.74 
 
 		 638 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.38 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.81 
 
 		 579 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.07 
 
 		 605 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.18 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  44.29 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.72 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  43.33 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.91 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.99 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.54 
 
 		 571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.1 
 
 		 569 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.68 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.23 
 
 		 568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.06 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.56 
 
 		 626 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.51 
 
 		 583 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  31.84 
 
 		 590 aa  269  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  32.66 
 
 		 605 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  31.11 
 
 		 605 aa  264  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  32.59 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.74 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  32.04 
 
 		 582 aa  257  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.29 
 
 		 613 aa  255  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  32.49 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.58 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.48 
 
 		 616 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.59 
 
 		 597 aa  241  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  29.22 
 
 		 607 aa  229  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.53 
 
 		 636 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  27.05 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.05 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 		 662 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  34.32 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  117  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.87 
 
 		 304 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  26.32 
 
 		 311 aa  97.1  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.29 
 
 		 304 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.84 
 
 		 316 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.18 
 
 		 313 aa  88.6  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.91 
 
 		 316 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.63 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.51 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.71 
 
 		 303 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.24 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  24.89 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.99 
 
 		 292 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  27.43 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  26.78 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.97 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  32.41 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.69 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.95 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  26.76 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  30.14 
 
 		 282 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.47 
 
 		 265 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.87 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  30.37 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  27.3 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  28.17 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  27.65 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  26.71 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  27.3 
 
 		 332 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.75 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  31.21 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  28.02 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  27.03 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.36 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  27.17 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  27.44 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  27.17 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  32.26 
 
 		 307 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  30.3 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  30.3 
 
 		 281 aa  57  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  28.26 
 
 		 320 aa  57  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  26.26 
 
 		 321 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.63 
 
 		 270 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  25.96 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1616  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.89 
 
 		 271 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3632  hypothetical protein  25.78 
 
 		 305 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  32.22 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  25.97 
 
 		 618 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  26.62 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>