128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0583 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
584 aa  1207    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  47.23 
 
 
591 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.05 
 
 
626 aa  318  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  34 
 
 
590 aa  313  6.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  34.1 
 
 
607 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  34.62 
 
 
605 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.19 
 
 
616 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.87 
 
 
597 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  33.45 
 
 
582 aa  296  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  33.45 
 
 
586 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.56 
 
 
662 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  32.67 
 
 
587 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.27 
 
 
636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.91 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.3 
 
 
583 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.87 
 
 
600 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  29.83 
 
 
605 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.51 
 
 
611 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.6 
 
 
576 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.91 
 
 
568 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.72 
 
 
569 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.59 
 
 
571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  29.28 
 
 
586 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.68 
 
 
591 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  26.45 
 
 
583 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  28.73 
 
 
619 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.97 
 
 
638 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.17 
 
 
633 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.42 
 
 
638 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.55 
 
 
579 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.31 
 
 
571 aa  184  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.61 
 
 
570 aa  183  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.23 
 
 
638 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.43 
 
 
629 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.43 
 
 
629 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.89 
 
 
624 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.64 
 
 
568 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.67 
 
 
630 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.08 
 
 
573 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.17 
 
 
571 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.05 
 
 
569 aa  177  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  27.05 
 
 
571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.53 
 
 
605 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.29 
 
 
571 aa  157  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  30.74 
 
 
311 aa  108  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.7 
 
 
304 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  26.13 
 
 
295 aa  93.6  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.37 
 
 
313 aa  92  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  24.57 
 
 
309 aa  90.5  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  25 
 
 
292 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  26.39 
 
 
324 aa  86.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.26 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  27.37 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.32 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.96 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.13 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.45 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.87 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0467  hypothetical protein  26.71 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0419567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.45 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.57 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.35 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  24.9 
 
 
275 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  25.19 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  27.4 
 
 
271 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.86 
 
 
281 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  26.6 
 
 
307 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  26.5 
 
 
270 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  27.01 
 
 
258 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  29.25 
 
 
280 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  25.97 
 
 
277 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.42 
 
 
258 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.63 
 
 
317 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  25.8 
 
 
270 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  25.41 
 
 
277 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  25.82 
 
 
278 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  26.24 
 
 
250 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  26.24 
 
 
250 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  26.24 
 
 
250 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  26.47 
 
 
272 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  26.47 
 
 
301 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  26.69 
 
 
268 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  26.47 
 
 
272 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  26.47 
 
 
272 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  26.69 
 
 
268 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  25.23 
 
 
291 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  28.08 
 
 
338 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  25.23 
 
 
291 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56560  hypothetical protein  27.65 
 
 
251 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492473  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  26.52 
 
 
283 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.7 
 
 
331 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.97 
 
 
268 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2719  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.82 
 
 
267 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  26.07 
 
 
268 aa  51.2  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  29.56 
 
 
268 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1293  putative hemolysin-like protein  29.56 
 
 
268 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418328  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  32 
 
 
281 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.11 
 
 
292 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  26.81 
 
 
320 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1892  putative hemolysin  29.32 
 
 
251 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185839  normal  0.463503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>