121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1245 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  57.75 
 
 		 619 aa  699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 591 aa  1233    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.14 
 
 		 629 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.31 
 
 		 629 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  58.63 
 
 		 579 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  56.97 
 
 		 624 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  55.46 
 
 		 586 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.32 
 
 		 569 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.19 
 
 		 638 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  58.8 
 
 		 605 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.15 
 
 		 630 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.02 
 
 		 638 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.19 
 
 		 638 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  70.92 
 
 		 583 aa  843    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.19 
 
 		 633 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.11 
 
 		 571 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.09 
 
 		 568 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.29 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.3 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.18 
 
 		 573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.26 
 
 		 571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.65 
 
 		 570 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.68 
 
 		 568 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.37 
 
 		 576 aa  558  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  45.18 
 
 		 571 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.85 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  31.35 
 
 		 605 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  31.35 
 
 		 586 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  32.72 
 
 		 582 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.16 
 
 		 583 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  30.47 
 
 		 590 aa  260  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  31.47 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.05 
 
 		 600 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  31.53 
 
 		 607 aa  253  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.63 
 
 		 597 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.29 
 
 		 626 aa  247  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.26 
 
 		 611 aa  246  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.85 
 
 		 613 aa  239  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  28.79 
 
 		 605 aa  236  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.51 
 
 		 616 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.1 
 
 		 636 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.68 
 
 		 584 aa  193  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  29.09 
 
 		 591 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.12 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  31.82 
 
 		 275 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  32.03 
 
 		 324 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.48 
 
 		 304 aa  92  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  25.88 
 
 		 311 aa  90.1  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 304 aa  87.4  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.65 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.35 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.21 
 
 		 316 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.91 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.38 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.28 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  28 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.87 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.87 
 
 		 294 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.31 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  23.01 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.43 
 
 		 281 aa  62  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  22.58 
 
 		 295 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  34.4 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  34.4 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  33.06 
 
 		 291 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.11 
 
 		 292 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  33.33 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  21.43 
 
 		 317 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  36.11 
 
 		 249 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  32.5 
 
 		 297 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  31.78 
 
 		 258 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  27.9 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.77 
 
 		 266 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  36.27 
 
 		 315 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  30.47 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  31.2 
 
 		 296 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  27.54 
 
 		 332 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  31.17 
 
 		 332 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  27.95 
 
 		 312 aa  50.4  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  32.41 
 
 		 307 aa  50.4  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  28.16 
 
 		 332 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  32.2 
 
 		 337 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  30.88 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.09 
 
 		 253 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  32.41 
 
 		 283 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  32.68 
 
 		 384 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  33.62 
 
 		 277 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  33.62 
 
 		 277 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  33.07 
 
 		 304 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  29.41 
 
 		 270 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  31.36 
 
 		 321 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.73 
 
 		 250 aa  47  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0424  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.71 
 
 		 284 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  31.9 
 
 		 246 aa  47  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  24.89 
 
 		 258 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.78 
 
 		 277 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.78 
 
 		 277 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>