More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1564 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  66.09 
 
 		 644 aa  829    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  58.4 
 
 		 654 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.02 
 
 		 637 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1279    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.93 
 
 		 644 aa  844    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  55.52 
 
 		 626 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.65 
 
 		 632 aa  969    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  65.62 
 
 		 644 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  65.62 
 
 		 644 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  65.93 
 
 		 644 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  93.22 
 
 		 635 aa  1209    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.86 
 
 		 662 aa  686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.64 
 
 		 651 aa  687    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  66.4 
 
 		 644 aa  849    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  56.65 
 
 		 652 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.74 
 
 		 653 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  66.35 
 
 		 645 aa  849    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  92.74 
 
 		 635 aa  1201    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.74 
 
 		 634 aa  956    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.93 
 
 		 644 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.77 
 
 		 644 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.77 
 
 		 644 aa  839    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  66.4 
 
 		 645 aa  858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.93 
 
 		 644 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  58.83 
 
 		 644 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  56.72 
 
 		 658 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.64 
 
 		 651 aa  686    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  67.14 
 
 		 604 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.32 
 
 		 644 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.93 
 
 		 645 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  59.58 
 
 		 632 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  67.14 
 
 		 604 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  65.62 
 
 		 644 aa  841    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  51.49 
 
 		 624 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  51.33 
 
 		 624 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.43 
 
 		 624 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  49.29 
 
 		 624 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  49.76 
 
 		 624 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.84 
 
 		 625 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.08 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.45 
 
 		 624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.45 
 
 		 661 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.61 
 
 		 625 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.45 
 
 		 625 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.48 
 
 		 629 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  45.5 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  44.62 
 
 		 626 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  45.78 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  45.1 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.25 
 
 		 620 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  45.75 
 
 		 618 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.48 
 
 		 621 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  43.28 
 
 		 624 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  42.57 
 
 		 624 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.2 
 
 		 620 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.9 
 
 		 620 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.73 
 
 		 620 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.2 
 
 		 620 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.04 
 
 		 620 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.36 
 
 		 620 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  44.04 
 
 		 620 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.04 
 
 		 620 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.23 
 
 		 618 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.21 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  51.96 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  50.11 
 
 		 453 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.35 
 
 		 1155 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.18 
 
 		 1138 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.28 
 
 		 1138 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  37.26 
 
 		 1137 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.02 
 
 		 1144 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.66 
 
 		 1114 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.01 
 
 		 1138 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.73 
 
 		 1131 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 1185 aa  300  6e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.36 
 
 		 1128 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.13 
 
 		 1131 aa  293  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  41.41 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  41.41 
 
 		 435 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.22 
 
 		 1131 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.68 
 
 		 589 aa  290  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.99 
 
 		 1136 aa  290  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.44 
 
 		 1124 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.22 
 
 		 1146 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.54 
 
 		 1139 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.33 
 
 		 1139 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 429 aa  269  8.999999999999999e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.82 
 
 		 1129 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 438 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 440 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 430 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 1049 aa  233  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 435 aa  230  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.87 
 
 		 888 aa  226  7e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>