203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0885 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  99.67 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  99.33 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  99.33 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  98.66 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  88.29 
 
 		 308 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  87.96 
 
 		 299 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  88.29 
 
 		 299 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  88.29 
 
 		 299 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  88.29 
 
 		 299 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  88.29 
 
 		 308 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  87.96 
 
 		 299 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  87.29 
 
 		 308 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  86.96 
 
 		 299 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  79.26 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  65.22 
 
 		 299 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50.49 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  44.28 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  44.85 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  42.11 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.81 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  40.66 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.89 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  38.43 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  38.8 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  42.25 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.68 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.93 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.88 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  39.93 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  38.38 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  42.12 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  37.29 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  39.86 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  36 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.08 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.53 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.48 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  37.31 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  37.55 
 
 		 318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.22 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  34.62 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.67 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.93 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.59 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.97 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.44 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.05 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.51 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.28 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  37.69 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  37.78 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  40 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.66 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.45 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  34.11 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  34.11 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  34.56 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  34.88 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.74 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  34.88 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  34.22 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  33.89 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  34.28 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  34.62 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.33 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.6 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2407  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  41.92 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.76 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  28.11 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.18 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  26.6 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  33.15 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.78 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.42 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.27 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  33.15 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.78 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.41 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.78 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.18 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.41 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.91 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.41 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.41 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.41 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.04 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  27.11 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.25 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.21 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  33.52 
 
 		 215 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.74 
 
 		 243 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>