More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4091 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  100 
 
 		 305 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  62.09 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  63.73 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  54.25 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  47.62 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  41.72 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  44.11 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  44.82 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.57 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.81 
 
 		 294 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  44.93 
 
 		 307 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.13 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.95 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  43.02 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  39.46 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.41 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.7 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.46 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  42.61 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.58 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  40.68 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  39.93 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  41.53 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.6 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  40.79 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.29 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  40.52 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.08 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  44.09 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.3 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.8 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.2 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  37 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  39.07 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  39.6 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  40.13 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  36.61 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.91 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  36.61 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.18 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.49 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.81 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  40.81 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  40.85 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.81 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.81 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  40.49 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.49 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  40.49 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  40.49 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  40.49 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  40.49 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  40 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  38.03 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  40.14 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  34.92 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.97 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  43.59 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  34.58 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  38.13 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  34.33 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  34.58 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  34.58 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  34.58 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  34.58 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  34.58 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  34 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  39.33 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  34.52 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.23 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.58 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.68 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.68 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  29.68 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.68 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.68 
 
 		 265 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.68 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.68 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.68 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  29.68 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  34.21 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.64 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  33.16 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  34.55 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.72 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2245  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.18 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  32.16 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  32.46 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.57 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.71 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1728  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.18 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.28 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2346  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.18 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1996  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.18 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.28 
 
 		 246 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>