More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2474 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  100 
 
 		 245 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  80.25 
 
 		 246 aa  427  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  79.34 
 
 		 246 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  78.51 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  78.93 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  79.34 
 
 		 246 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  79.01 
 
 		 246 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  79.01 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  77.69 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  79.01 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  79.01 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2407  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  77.96 
 
 		 245 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  76.45 
 
 		 246 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  75.62 
 
 		 246 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  77.27 
 
 		 246 aa  410  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  74.9 
 
 		 246 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1618  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  66.67 
 
 		 244 aa  349  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2591  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  66.67 
 
 		 244 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2679  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  66.67 
 
 		 265 aa  349  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.37 
 
 		 265 aa  348  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2245  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  65.55 
 
 		 246 aa  347  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.29 
 
 		 265 aa  347  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.29 
 
 		 265 aa  347  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.29 
 
 		 265 aa  347  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.29 
 
 		 265 aa  347  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.29 
 
 		 265 aa  347  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.763935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  63.37 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  63.37 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.37 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.37 
 
 		 255 aa  347  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.37 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.37 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  63.37 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  62.96 
 
 		 246 aa  345  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2346  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.79 
 
 		 246 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.87 
 
 		 246 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1728  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.71 
 
 		 246 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1996  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.29 
 
 		 246 aa  342  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1701  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.14 
 
 		 246 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  60.68 
 
 		 246 aa  328  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.07 
 
 		 246 aa  325  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  61.48 
 
 		 246 aa  324  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  59.75 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1147  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  61.76 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  52.92 
 
 		 243 aa  276  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  52.92 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  52.92 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  52.5 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  52.5 
 
 		 243 aa  274  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  52.5 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  52.5 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  51.25 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  51.25 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  51.25 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  51.9 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  56.28 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  51.25 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.52 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.98 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  45.92 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.89 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2365  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.64 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1999  pyruvate-formate lyase activating enzyme  48.32 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  47.39 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0217  pyruvate formate-lyase activating enzyme  49.37 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0211  pyruvate formate-lyase activating enzyme  49.37 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  40.66 
 
 		 287 aa  224  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  42.13 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  42.13 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1398  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  47.28 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  42.06 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  45 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40.85 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.98 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1081  pyruvate formate-lyase activating  43.57 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2981  pyruvate formate-lyase activating  43.57 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.743712  normal  0.290746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2097  radical SAM family protein  42.5 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  38.56 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0038  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.86 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.44 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  41.98 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  37.34 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  40.66 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0890  pyruvate formate-lyase activating  40.26 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.999298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  37.5 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  39.17 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3207  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40.08 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000377553  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  39.5 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1397  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40.17 
 
 		 310 aa  161  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.559642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  34.69 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  37.69 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  30.95 
 
 		 297 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  31.25 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.89 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  27.67 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  26.03 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36094  predicted protein  32.43 
 
 		 324 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  28.28 
 
 		 305 aa  124  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  27.95 
 
 		 306 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.59 
 
 		 294 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>