220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4520 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  99.66 
 
 
292 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  100 
 
 
292 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  78.77 
 
 
292 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  78.77 
 
 
292 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  78.77 
 
 
292 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  78.77 
 
 
292 aa  481  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  78.77 
 
 
292 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  78.77 
 
 
292 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  78.77 
 
 
292 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  78.42 
 
 
292 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  80.07 
 
 
279 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  43.91 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  38.36 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.61 
 
 
305 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.48 
 
 
316 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.96 
 
 
298 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.44 
 
 
303 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.12 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  38.55 
 
 
258 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.57 
 
 
316 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.5 
 
 
294 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.98 
 
 
310 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  31.51 
 
 
310 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  31.94 
 
 
322 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  36.4 
 
 
309 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  36.2 
 
 
307 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.42 
 
 
299 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  35.05 
 
 
306 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  36.1 
 
 
263 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  32.78 
 
 
306 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  34.34 
 
 
318 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.14 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.45 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.54 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  33.56 
 
 
297 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.82 
 
 
304 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  31.85 
 
 
306 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  33.58 
 
 
302 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.44 
 
 
260 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  33.21 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.81 
 
 
298 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  34.24 
 
 
311 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  33.11 
 
 
320 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.13 
 
 
310 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.09 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.01 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  33.77 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  34.23 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.49 
 
 
309 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  31.31 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.61 
 
 
314 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  35.55 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  33.66 
 
 
308 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  33.66 
 
 
308 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  34.06 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.33 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.55 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  31.25 
 
 
287 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  33.78 
 
 
299 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  33.78 
 
 
299 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.22 
 
 
299 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.22 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  34.22 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  33.78 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.22 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  33.44 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.44 
 
 
299 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  33.44 
 
 
299 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  30.52 
 
 
315 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.4 
 
 
247 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.98 
 
 
238 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.87 
 
 
250 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.84 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.43 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.81 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  26.87 
 
 
243 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.46 
 
 
245 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.24 
 
 
312 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27 
 
 
247 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.74 
 
 
246 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.542279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  25.74 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.74 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  25.74 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.74 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.74 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.74 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.74 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.61 
 
 
265 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.61 
 
 
265 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.61 
 
 
265 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.61 
 
 
265 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.24 
 
 
243 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.61 
 
 
265 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
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NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  26.87 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.87 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.49 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.49 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.87 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.49 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.87 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
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