206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2524 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  100 
 
 		 308 aa  638    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  98.38 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  98.38 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  98.33 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  98.33 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  97.66 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  97.66 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  96.66 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  96.99 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  87.29 
 
 		 299 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  87.29 
 
 		 299 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  87.29 
 
 		 299 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  87.29 
 
 		 299 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  87.29 
 
 		 299 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  76.59 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  64.88 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  47.57 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  41.18 
 
 		 309 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.65 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.49 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  41.5 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  41.76 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.91 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  38.16 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  39.42 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.15 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  39.16 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  39.06 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.65 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  41.09 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.2 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  39.07 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  40.91 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.22 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  36.79 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  36.9 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  40.3 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.84 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.46 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.95 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.46 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  38.58 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.03 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.11 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.27 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.43 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  39.38 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.48 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.87 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.93 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  38.43 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.38 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.05 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.45 
 
 		 273 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.39 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  32 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  35.06 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  33.98 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  33.99 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  34.74 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  33.99 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  33.99 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  34.74 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  33.99 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  34.09 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  33.33 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  35.84 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  34.04 
 
 		 348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  34.25 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.46 
 
 		 235 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.46 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.24 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.33 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  28.47 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.4 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.09 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.06 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  30.57 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2407  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.94 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  33.16 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.84 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.47 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.02 
 
 		 250 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.59 
 
 		 238 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.17 
 
 		 246 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  26.74 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.42 
 
 		 240 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.11 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.21 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.5 
 
 		 246 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.67 
 
 		 246 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.47 
 
 		 246 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.74 
 
 		 243 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  26.74 
 
 		 243 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.67 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.67 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>