261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1175 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.13 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  39.53 
 
 		 310 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  42.19 
 
 		 306 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  37.71 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  35.74 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  41.45 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  39.92 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.95 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.53 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.64 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.55 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  39.3 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.46 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  37.21 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.58 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  36.58 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  38.82 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.01 
 
 		 314 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.05 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.46 
 
 		 298 aa  174  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.67 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  37.55 
 
 		 302 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.36 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.42 
 
 		 316 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  36.1 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  36.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  36.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  36.1 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.36 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1728  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.18 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1996  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.18 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.74 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2346  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.14 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.51 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  34.54 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.74 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.43 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  34.39 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1701  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.18 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.55 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.95 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.55 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2245  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.34 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.55 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.46 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.46 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.46 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.46 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.46 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.34 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.18 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.55 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.55 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.14 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  34.54 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.55 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.74 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  36.14 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  37.31 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  37.55 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  33.33 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.51 
 
 		 316 aa  161  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.2 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2679  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.34 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.98 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  33.99 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2591  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.22 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1618  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  35.22 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  33.86 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.58 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  34.69 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.43 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  34.54 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.64 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  33.6 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  33.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  35.15 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  33.6 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  33.46 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  34.55 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  33.6 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  34.55 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.35 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  38.43 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  38.43 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  38.43 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  38.43 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  38.43 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>