244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0490 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  100 
 
 		 307 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  76.16 
 
 		 309 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  62.08 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  59.79 
 
 		 312 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  50.65 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  49.17 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  53.33 
 
 		 298 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  44.93 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  49.08 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  42.39 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  44.9 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  44.96 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  42.38 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.86 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.93 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  45.48 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  40.26 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  44.49 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.48 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.75 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.62 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  38.13 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  39.23 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  40.55 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.12 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  42.75 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.4 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  40.41 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.67 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  41.67 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.11 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.11 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  42.11 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  42.11 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  41.84 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  41.67 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  41.84 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  41.67 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.75 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.5 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  41.32 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  40.56 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  43.15 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  40.62 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  41.61 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.25 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  34.58 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.76 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  40.49 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.7 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.84 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.86 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.23 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.39 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  36.07 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  36.2 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.2 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  36.96 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.25 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.56 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  33.45 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  33.11 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  33.11 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  33.11 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  33.56 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  33.11 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  33.11 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  32.77 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  37.14 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  37.29 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.3 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1777  (Formate-C-acetyltransferase)-activating enzyme  28.23 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000493175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1578  radical SAM family protein  30.82 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  32.61 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.04 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.43 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  32.07 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.581706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.07 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  31.96 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  35.15 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.82 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  31.96 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.49 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.49 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  30.93 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  30.93 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>