More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1282 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  100 
 
 		 213 aa  436  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  69.57 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  63.68 
 
 		 210 aa  288  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  49.28 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  50 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  48.82 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  47.66 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  50 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  47.66 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 255 aa  185  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  46.83 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  47.32 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  49.27 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  45.24 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  48.31 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  47.91 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  48.37 
 
 		 214 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  46.95 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  46.15 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  42.86 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  44.6 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  43.96 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  41.9 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  41.24 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  41.24 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  44.1 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  42.44 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  43.2 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  41.3 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  44.39 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  38.03 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  37.33 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  37.32 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  38.28 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  30.93 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  35.9 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  35.9 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  37.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  37.04 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  37.91 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  36.06 
 
 		 228 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  35.89 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  36.1 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  32.08 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  36.95 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  34.93 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  34.93 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  35.89 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  32.68 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  33 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  35.12 
 
 		 217 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.68 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  34.15 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  35.58 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  35.27 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  36.89 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  36.79 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  34.95 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  32.69 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  34.13 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  35.08 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  35.18 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  30.88 
 
 		 213 aa  117  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  32.66 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  32.66 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  31.71 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  36.06 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  35.58 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  29.9 
 
 		 267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  32.68 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  32.66 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  32.68 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  29.9 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  32.68 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  30.88 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  33.17 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  31.25 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  34.13 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  35.29 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>