More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3185 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  100 
 
 		 215 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  77.25 
 
 		 213 aa  354  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  76.78 
 
 		 213 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  74.88 
 
 		 213 aa  345  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  74.52 
 
 		 214 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  72.6 
 
 		 213 aa  336  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  73.56 
 
 		 214 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  59.42 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  56.1 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  58.05 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  59.02 
 
 		 225 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  51.43 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  51.2 
 
 		 214 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  52.2 
 
 		 214 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  48.33 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  50.72 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  51.96 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  49.53 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  48.78 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  48.82 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  49.28 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  50 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  45.59 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  47.21 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  40.76 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  45.88 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  41.98 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  40.19 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  42.79 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  39.72 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  42.79 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  41.79 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  42.08 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  43.84 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  43 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  39.34 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  38.73 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  41.83 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.57 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  38.54 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  37.26 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  45.16 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  35.96 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.71 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.78 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.51 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  35.82 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  35.32 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  35.82 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  39.22 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  36.23 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  35.05 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  35.12 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  33.85 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  35.12 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  31.71 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  34.93 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  34.63 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  37.14 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  35.96 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  33.17 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  33.99 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  35.96 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  34.48 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  36.32 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  38.25 
 
 		 739 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  31.22 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  34.83 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  30.73 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  37.37 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>