More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3223 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  75 
 
 
214 aa  347  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  74.52 
 
 
215 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  71.83 
 
 
213 aa  338  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  70.75 
 
 
213 aa  328  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  71.36 
 
 
213 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  70.89 
 
 
213 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  63.29 
 
 
218 aa  290  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  55.77 
 
 
216 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  60.49 
 
 
225 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  58.65 
 
 
225 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  53.08 
 
 
214 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  52.61 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  52.2 
 
 
220 aa  230  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  51.2 
 
 
214 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  52.4 
 
 
214 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  51.71 
 
 
216 aa  221  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  50.48 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  52.43 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  52.43 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  51.69 
 
 
228 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  52.4 
 
 
221 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  51.21 
 
 
242 aa  204  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  50 
 
 
224 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  50 
 
 
213 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  49.48 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  45.85 
 
 
213 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  45.81 
 
 
214 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  47.06 
 
 
210 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  45.05 
 
 
255 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  41.71 
 
 
216 aa  175  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  44.29 
 
 
216 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  46.08 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  42.86 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  43.3 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  43.3 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  43.33 
 
 
216 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  46.12 
 
 
211 aa  167  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  45.1 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  43.06 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  42.11 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  42.11 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  44.34 
 
 
244 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  40.58 
 
 
210 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  40.69 
 
 
214 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  39.29 
 
 
209 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  39.29 
 
 
209 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  45.96 
 
 
209 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.73 
 
 
218 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  37.74 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  44.09 
 
 
185 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  39.53 
 
 
230 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  36.62 
 
 
225 aa  142  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  37.02 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.71 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  36.82 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.63 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 
200 aa  138  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  40.29 
 
 
237 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  35.53 
 
 
211 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  35.53 
 
 
211 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  40.78 
 
 
230 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.13 
 
 
207 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  35.53 
 
 
211 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  36.71 
 
 
235 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  34.15 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  36.45 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  37.31 
 
 
251 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  35.61 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  39.61 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  35.44 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  39.61 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  33 
 
 
213 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.1 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  34.16 
 
 
236 aa  128  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  37.19 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  35.81 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  34.83 
 
 
219 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  34.83 
 
 
219 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  34.83 
 
 
219 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  38.61 
 
 
220 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  34.33 
 
 
219 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  33.51 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  38 
 
 
231 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  38.42 
 
 
228 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  35.03 
 
 
229 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  35.37 
 
 
255 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
220 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  33.82 
 
 
211 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  34.15 
 
 
239 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  34.15 
 
 
239 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  34.33 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  38.12 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  31.53 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  33.82 
 
 
242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  34.63 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  34.15 
 
 
239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  32.86 
 
 
224 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  36.76 
 
 
201 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  34.31 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>