More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3054 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 258 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  98.01 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  93.07 
 
 		 235 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  75.59 
 
 		 230 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  74.43 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  59.68 
 
 		 234 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  60.73 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  54.71 
 
 		 230 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  54.71 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  53.74 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  53.74 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  51.83 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  51.38 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  52.09 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  52.13 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  51.66 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  51.66 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  51.66 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  48.33 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  47.25 
 
 		 218 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  50.47 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 231 aa  208  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 211 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  49.77 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  50.49 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  49.5 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  50.99 
 
 		 211 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  49.5 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  47.95 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  48.15 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  48.15 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  48.15 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  50 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  48.77 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  47.22 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  47.93 
 
 		 219 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  47.6 
 
 		 211 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  49.26 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  45.05 
 
 		 236 aa  198  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  48.51 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  48.53 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  50 
 
 		 211 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  44.75 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  44.75 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  45.05 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  44.75 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  45.87 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  44.75 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  44.75 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  44.75 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  47.25 
 
 		 219 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  49.02 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  48.53 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  48.53 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  48.53 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  48.53 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  44.29 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  46.04 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  44.29 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  45.67 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  44.71 
 
 		 227 aa  188  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  42.93 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  41.7 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  46.67 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  41.35 
 
 		 356 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  40.87 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  44.04 
 
 		 284 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  50.93 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  44.68 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 214 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  40.18 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 216 aa  149  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.07 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.07 
 
 		 209 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 209 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  36.41 
 
 		 211 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  34.76 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 214 aa  142  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 		 210 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  43.08 
 
 		 193 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.53 
 
 		 200 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  38.43 
 
 		 877 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  34.1 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  34.11 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 207 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  37.13 
 
 		 215 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>