More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3061 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  48.5 
 
 		 255 aa  194  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  45.59 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  48.53 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  46.08 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  45.85 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  45.1 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  44.98 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  45.19 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  44.76 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  45.85 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  44.93 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  45.24 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  42.16 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  42.31 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  43.54 
 
 		 228 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  43.27 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  43.13 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  42.38 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  45.93 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  43.33 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  43.41 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  42.25 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  42.44 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  39.23 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  46.15 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  39.23 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  41.55 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  42.44 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  42.58 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  43.48 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  35.71 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  38.39 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  40.38 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  41.79 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  41.71 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  39.22 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.6 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  39.71 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  38.89 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.38 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  38.89 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  42.71 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.81 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  40.29 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  40.29 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  38.31 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  35.15 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  35.5 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  34.78 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.38 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  31.68 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  42.02 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  32.85 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  35.21 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  36.54 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  35.98 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  33.18 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.83 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  34.48 
 
 		 248 aa  131  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  31.75 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  35.89 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 267 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 267 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  37.37 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  35.41 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  34.91 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  35.96 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  34.96 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  32.7 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  35.07 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  35.07 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  35.07 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  35.07 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  35.07 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  35.1 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  33.82 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  33.96 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>