More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2116 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  100 
 
 
213 aa  443  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  89.1 
 
 
214 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  64.88 
 
 
222 aa  286  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  58.37 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  58.85 
 
 
211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  58.85 
 
 
211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  59.81 
 
 
210 aa  279  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  54.15 
 
 
210 aa  241  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  50.24 
 
 
207 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  47.55 
 
 
213 aa  221  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  50.25 
 
 
200 aa  217  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  42.16 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  42.16 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  38.86 
 
 
224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  43.72 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  40.69 
 
 
221 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  42.58 
 
 
219 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  39.91 
 
 
219 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  43.2 
 
 
239 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  37.14 
 
 
227 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  39.71 
 
 
242 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.09 
 
 
230 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  37.07 
 
 
213 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.11 
 
 
228 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  40.3 
 
 
246 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  40.58 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.89 
 
 
210 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  39.38 
 
 
207 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  41.95 
 
 
243 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.76 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  40.8 
 
 
225 aa  156  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.76 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.76 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.76 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.76 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.76 
 
 
219 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  36.82 
 
 
225 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  36.27 
 
 
225 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  42.44 
 
 
239 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  42.44 
 
 
239 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  39.34 
 
 
220 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  39.9 
 
 
219 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  37.68 
 
 
248 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  40.61 
 
 
278 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  41.35 
 
 
239 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  38.46 
 
 
217 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.15 
 
 
230 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.28 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  39.02 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  38.16 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  38.68 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  38.1 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  38.16 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  37.8 
 
 
219 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  38.16 
 
 
219 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  38.16 
 
 
219 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  38.16 
 
 
219 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  38.16 
 
 
219 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  37.2 
 
 
218 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  41.38 
 
 
231 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  38.54 
 
 
242 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  36.7 
 
 
234 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  37.38 
 
 
211 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  40.61 
 
 
284 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  39.6 
 
 
211 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 
213 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  37.98 
 
 
220 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 
213 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  39.11 
 
 
356 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
237 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  37.02 
 
 
219 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  41.23 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  39.39 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  37.62 
 
 
225 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  37.38 
 
 
219 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
225 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
221 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  36.32 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  36.32 
 
 
223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  35.68 
 
 
230 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  38.83 
 
 
211 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  37.38 
 
 
214 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  38.35 
 
 
211 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  36.63 
 
 
211 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  36.71 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  35.32 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  33.99 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  35.57 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  35.68 
 
 
255 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  38.05 
 
 
234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  34.12 
 
 
228 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  32.85 
 
 
217 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  34.78 
 
 
213 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  32.84 
 
 
210 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  33.65 
 
 
244 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  32.85 
 
 
218 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  34.63 
 
 
235 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>