More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1895 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  50.5 
 
 
224 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  47.6 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  52.04 
 
 
284 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  49.03 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  47.78 
 
 
267 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  47.78 
 
 
267 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  45.23 
 
 
236 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  39.91 
 
 
246 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  41.46 
 
 
239 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  41.75 
 
 
242 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  41.95 
 
 
239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  41.95 
 
 
239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  42.31 
 
 
243 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  40.98 
 
 
239 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  38.79 
 
 
221 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  41.12 
 
 
218 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  48.19 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  42.21 
 
 
217 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  40.8 
 
 
219 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  40.89 
 
 
211 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  38.83 
 
 
242 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  40 
 
 
225 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  41.29 
 
 
219 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  41.21 
 
 
211 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  41.36 
 
 
251 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  38.35 
 
 
242 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  39.3 
 
 
230 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.69 
 
 
219 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.69 
 
 
219 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.69 
 
 
219 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.69 
 
 
219 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  38.64 
 
 
225 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  39.3 
 
 
239 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.69 
 
 
219 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.69 
 
 
219 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  36.99 
 
 
220 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  40 
 
 
223 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  41.21 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  41.35 
 
 
258 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  40.29 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  41.15 
 
 
234 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  40 
 
 
216 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  40 
 
 
219 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  39.7 
 
 
219 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  40.29 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  40.39 
 
 
219 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.19 
 
 
219 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  39.2 
 
 
234 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  40.2 
 
 
219 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.19 
 
 
219 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  41.04 
 
 
787 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  39.2 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  41.21 
 
 
211 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  39.2 
 
 
219 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  39.2 
 
 
219 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  40.38 
 
 
231 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  39.2 
 
 
219 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  39.2 
 
 
219 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  36.53 
 
 
220 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  40.2 
 
 
211 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  39 
 
 
219 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  41.21 
 
 
211 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  39.61 
 
 
229 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  38.61 
 
 
217 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  38.03 
 
 
234 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
219 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
219 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
219 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.19 
 
 
219 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  42.25 
 
 
202 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  44.12 
 
 
213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  37.91 
 
 
230 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  42.51 
 
 
222 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  35.27 
 
 
207 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  40.31 
 
 
200 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  40.61 
 
 
207 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  38.01 
 
 
227 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  40 
 
 
210 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  38.5 
 
 
225 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  40.3 
 
 
214 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  39.41 
 
 
754 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  37.93 
 
 
210 aa  149  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  39.11 
 
 
216 aa  149  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  39.11 
 
 
213 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  34.38 
 
 
877 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  39.89 
 
 
211 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  39.11 
 
 
211 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  39.11 
 
 
211 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  39.11 
 
 
211 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  39.09 
 
 
749 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  39.25 
 
 
233 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  40.72 
 
 
193 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  37.75 
 
 
230 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 
210 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  35.78 
 
 
230 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  36.73 
 
 
739 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  36.32 
 
 
237 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  32.85 
 
 
214 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  32.69 
 
 
218 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>