More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0504 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  63.02 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  63.73 
 
 		 194 aa  255  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  51.81 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  51.81 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  51.58 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  49.22 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  52.33 
 
 		 195 aa  204  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  52.33 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  48.98 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  49.74 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  43.52 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  43.08 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  43.59 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  43.08 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40.72 
 
 		 356 aa  141  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  42.05 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  40.31 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  40.51 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  39.79 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  36.79 
 
 		 217 aa  130  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  37.31 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  36.6 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  38.27 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  36.56 
 
 		 215 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 219 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  38.14 
 
 		 242 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  38.22 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  38.22 
 
 		 236 aa  127  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  36.6 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  37.06 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  35.26 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  34.54 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  36.6 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  37.7 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  41.24 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  40.44 
 
 		 229 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  35.14 
 
 		 212 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  37.7 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  37.7 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  39.79 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  37.17 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  38.27 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  35.71 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  38.62 
 
 		 239 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  36.65 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  37.84 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  37.17 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  34.92 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  34.92 
 
 		 239 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  36.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  40.4 
 
 		 227 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  34.92 
 
 		 239 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  36.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  36.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  34.41 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  34.74 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  35.75 
 
 		 222 aa  121  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  38.66 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  37.1 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  37.7 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 267 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 267 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 227 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  36.78 
 
 		 726 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  36.84 
 
 		 278 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  36.65 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  36.65 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  36.65 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  36.65 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  37.04 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  36.46 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  33.86 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  34.55 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  34.55 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  34.55 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  35.6 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  36.92 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  33.86 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  32.8 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  33.16 
 
 		 206 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  35.05 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  34.18 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  34.36 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  34.76 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  36.65 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>