More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2617 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  68.7 
 
 		 229 aa  325  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  56.47 
 
 		 234 aa  264  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  56.34 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  54.71 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  54.26 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  54.26 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  54.67 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  50.92 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  51.38 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  49.3 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  48.84 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  48.84 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  48.84 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  48.84 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  50.73 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  52.43 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  49.76 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  48.37 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  47.03 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  48 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  48 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  47.93 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  48 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  48 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  48 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  48 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  48 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  47.51 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  48.79 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  49.28 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  52.5 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  47.14 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  49.76 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  47.56 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  53.3 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  50 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  47.91 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  48.31 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  45.87 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  48.8 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  51.94 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  45.41 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  45.41 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  45.41 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  49.52 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  48.53 
 
 		 219 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 217 aa  198  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  47.37 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.5 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  46.61 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  46.61 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  46.61 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  46.61 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  45.45 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  48.04 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  48.31 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  41.98 
 
 		 267 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  41.98 
 
 		 267 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.83 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  40.62 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  48.47 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  40.89 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  36.94 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  37.91 
 
 		 356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  45.4 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  39.29 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  36.94 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  37 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.92 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  36.28 
 
 		 210 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  40.09 
 
 		 787 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  32.84 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  34.67 
 
 		 233 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  35.92 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  38.14 
 
 		 739 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  35.96 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  31.28 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  36.6 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  35.86 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>