More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00785 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  100 
 
 
182 aa  373  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  60.57 
 
 
242 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  61.36 
 
 
248 aa  221  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  58.62 
 
 
242 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  58.05 
 
 
242 aa  210  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  52.87 
 
 
243 aa  197  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  54.6 
 
 
239 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  52.3 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  52.3 
 
 
246 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  54.02 
 
 
239 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  54.02 
 
 
239 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  54.02 
 
 
239 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  49.7 
 
 
217 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  52.76 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  51.55 
 
 
235 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  50.62 
 
 
229 aa  168  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  50.93 
 
 
258 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  47.8 
 
 
218 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  46.7 
 
 
251 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  50.3 
 
 
225 aa  164  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  49.69 
 
 
211 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  51.57 
 
 
219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  46.2 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  45.4 
 
 
230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  50.61 
 
 
219 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  50.62 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  50 
 
 
234 aa  161  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  49.67 
 
 
231 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  48.24 
 
 
216 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  47.34 
 
 
219 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  47.34 
 
 
223 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  47.8 
 
 
211 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  46.59 
 
 
234 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  47.83 
 
 
211 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  45.28 
 
 
211 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  47.83 
 
 
219 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  47.17 
 
 
211 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  49.07 
 
 
220 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  47.8 
 
 
220 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  45.14 
 
 
219 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  45.14 
 
 
219 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  44.38 
 
 
219 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  44.38 
 
 
219 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  44.38 
 
 
219 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  44.05 
 
 
211 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  42.35 
 
 
224 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  44.57 
 
 
219 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  44.57 
 
 
219 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  44.57 
 
 
219 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  44.57 
 
 
219 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  43.79 
 
 
219 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  44.51 
 
 
234 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  44.38 
 
 
219 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  43.68 
 
 
267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  43.68 
 
 
267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  45.96 
 
 
219 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  46.36 
 
 
278 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  43.79 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  43.79 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  43.79 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  43.79 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  43.79 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  43.79 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  47.06 
 
 
227 aa  144  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  38.41 
 
 
236 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  42.6 
 
 
219 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  43.2 
 
 
219 aa  141  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  43.84 
 
 
272 aa  137  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  40.91 
 
 
284 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  46.71 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  37.95 
 
 
227 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  40.12 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  39.87 
 
 
356 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  39.02 
 
 
207 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.48 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  38.6 
 
 
214 aa  122  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  39.13 
 
 
225 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  38.41 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  39.51 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  39.13 
 
 
225 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  42.5 
 
 
228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.88 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  35.93 
 
 
210 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  35.19 
 
 
233 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  37.74 
 
 
214 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  36.88 
 
 
211 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  36.88 
 
 
211 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  36.88 
 
 
211 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  36.16 
 
 
211 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  37.22 
 
 
787 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  36.88 
 
 
214 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  37.82 
 
 
213 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  37.27 
 
 
210 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  40.88 
 
 
237 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  36.42 
 
 
216 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  36.52 
 
 
225 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  38.36 
 
 
216 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  35.98 
 
 
222 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  32.53 
 
 
218 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  36.36 
 
 
754 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>