More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1447 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  100 
 
 
272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  56.3 
 
 
267 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  56.3 
 
 
267 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  61.6 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  56.34 
 
 
284 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  58 
 
 
224 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  57.67 
 
 
227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.59 
 
 
236 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  47.64 
 
 
242 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  47.12 
 
 
242 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  47.12 
 
 
248 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  45.03 
 
 
243 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  44.27 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  44.27 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  45.89 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  43.98 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  43.98 
 
 
239 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  43.98 
 
 
239 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  43.98 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  43.98 
 
 
239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  44.23 
 
 
217 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  44.71 
 
 
235 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  40.16 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  44.85 
 
 
225 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  42.93 
 
 
258 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  42.79 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  41.83 
 
 
211 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  46.03 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  45.55 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  45.55 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  40.87 
 
 
211 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  44.56 
 
 
234 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  41.63 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  48.19 
 
 
356 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  41.55 
 
 
219 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  41.55 
 
 
219 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  41.55 
 
 
219 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  42.78 
 
 
230 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  45.03 
 
 
217 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  43.27 
 
 
220 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  45.83 
 
 
219 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  43.46 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  45.83 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  43.46 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  43.46 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  45.83 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  43.46 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  43.46 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  45.83 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  43.46 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  42.66 
 
 
220 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  45.83 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  45.83 
 
 
219 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  44.27 
 
 
219 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  46.6 
 
 
234 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  40.95 
 
 
231 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  43.23 
 
 
219 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  42.93 
 
 
216 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  42.93 
 
 
219 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  42.93 
 
 
219 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  41.36 
 
 
211 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  42.86 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  41.54 
 
 
211 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  40.51 
 
 
211 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  41.62 
 
 
219 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  39.42 
 
 
219 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  39.81 
 
 
239 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  40.51 
 
 
229 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  40.85 
 
 
227 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  40.51 
 
 
207 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  36.94 
 
 
230 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  42.21 
 
 
202 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  42.27 
 
 
787 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  41.86 
 
 
225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  34.31 
 
 
210 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 
213 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  34 
 
 
200 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  37.06 
 
 
207 aa  148  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  41.88 
 
 
749 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.31 
 
 
209 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.31 
 
 
209 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  34.52 
 
 
211 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  37.37 
 
 
211 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  37.37 
 
 
211 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  37.37 
 
 
211 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  36.41 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.56 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.41 
 
 
213 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  36.73 
 
 
214 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  34.01 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
230 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  33.17 
 
 
210 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  35.57 
 
 
214 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  36.73 
 
 
233 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  38.58 
 
 
216 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  43.84 
 
 
182 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  34.02 
 
 
218 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  38.07 
 
 
215 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  38.78 
 
 
225 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.06 
 
 
228 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>