More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1380 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  59.91 
 
 		 218 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  58.77 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  55.02 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  56.1 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  56.1 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  52.58 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  50 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  50.46 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  49 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  47.96 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  45.93 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  41.55 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  36.49 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  45.75 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  38.76 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  40.38 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  42.44 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  45.27 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  42.08 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  42.51 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  41.83 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  40.49 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  43.07 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  40.87 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  42.64 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  42.29 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  42.58 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  42.11 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  40.69 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  44.32 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  42.58 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  42.29 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  40.58 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  45.95 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  42.79 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.11 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  43.65 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  39.22 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  39.22 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  37.62 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  39.22 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  39.61 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  39.39 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  40.49 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  40.49 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  38.03 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  40 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  38.94 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  39.13 
 
 		 209 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  40 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  41.09 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  37.02 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  40 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  43.07 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  37.68 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  40.72 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  40.59 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  37.38 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  37.75 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  40.59 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  42.08 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  40.59 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  40.59 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  36.73 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  40.8 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  36.1 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  35.18 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  35.18 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  37.56 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>