More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1526 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  85.96 
 
 		 228 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  57.33 
 
 		 221 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  57.02 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  56 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  52.63 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  52.36 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  52.61 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  52.17 
 
 		 216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  50.47 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  52.91 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 213 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  51.46 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  52.43 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  51.66 
 
 		 218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  49.76 
 
 		 213 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  48.58 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  46.76 
 
 		 242 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  46.88 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  43.96 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  44.12 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  41.75 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  44.66 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  43 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  44.28 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  40.49 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  38.79 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  38.76 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  34.98 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  34.98 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  40.49 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.32 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  38.97 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  40.85 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  37.98 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  37.98 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  36.94 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  41.33 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  39.58 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  39.58 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  39.58 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  36.22 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  40.45 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  41.8 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.8 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  39.2 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  38.83 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 213 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  35.58 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.29 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  33.69 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  37.11 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  35.79 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.84 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  38.34 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  34.48 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  31.75 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  34.2 
 
 		 739 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  38.27 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.45 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.82 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  34.15 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  35.5 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  34.15 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  34.3 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  36.65 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  33.18 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  33 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  31.19 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  31.19 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  31 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  31.19 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  34.11 
 
 		 787 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  33.81 
 
 		 754 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  31.71 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  35.07 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  32.52 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  32.04 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  30.89 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>