More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0240 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  100 
 
 		 210 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  63.68 
 
 		 213 aa  288  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  60.78 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  50 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  48.29 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  46.77 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  45.97 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  46.19 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  46.95 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  44.88 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  47.06 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  47.22 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  45.07 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  44.29 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  45.15 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  42.38 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  46.97 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  45.24 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  45.59 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  46.38 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  45.15 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  46.31 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  45.96 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  42.51 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  43.6 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  40.19 
 
 		 242 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40.95 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  39.05 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  41.67 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  40.19 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  43.84 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  46.49 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  40.49 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  40.49 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  39.22 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  39.22 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  39.44 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.94 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.25 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.76 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  37.31 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  37.31 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  31.96 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  36.89 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  36.24 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  36.54 
 
 		 787 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  32.68 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  32.68 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  40.51 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  40.61 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  32.68 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  35.29 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  35.6 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  35.03 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  39.2 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.19 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  32.98 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  32.84 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  36.32 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  32.98 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 248 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  34.98 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  34.43 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  35.6 
 
 		 272 aa  124  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  34.43 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  34.43 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  30.33 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  35.92 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  33 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  33.98 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.07 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  31.55 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  35.15 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  32.51 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 239 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  35.15 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  34.01 
 
 		 194 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>