More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0666 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  54.27 
 
 
255 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  45.05 
 
 
218 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  46.88 
 
 
228 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  46.88 
 
 
228 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  49.48 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  46.88 
 
 
228 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  46.88 
 
 
213 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  44.79 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  45.88 
 
 
215 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  45.32 
 
 
213 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  46.35 
 
 
216 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  44.04 
 
 
214 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  46.5 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  42.86 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  42.23 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  44.83 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  46 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  44.33 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  43 
 
 
242 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  44.79 
 
 
214 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  47.67 
 
 
218 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  45.79 
 
 
214 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  36.5 
 
 
206 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  36.5 
 
 
206 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  45.26 
 
 
214 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  44.16 
 
 
241 aa  167  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  45.96 
 
 
210 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  43.81 
 
 
214 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  43.3 
 
 
213 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  46.23 
 
 
244 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  43.48 
 
 
213 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  41.18 
 
 
214 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  45.15 
 
 
230 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  44.5 
 
 
221 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  44.33 
 
 
216 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  43 
 
 
209 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  43 
 
 
209 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  44.1 
 
 
213 aa  158  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  43.75 
 
 
225 aa  157  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  44.21 
 
 
225 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  39.38 
 
 
213 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  43.37 
 
 
224 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  38.02 
 
 
214 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  41.92 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  33.16 
 
 
200 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.95 
 
 
207 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  39.69 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.27 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  41.92 
 
 
209 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  38.21 
 
 
235 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  37.98 
 
 
251 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  37.04 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  38.81 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  39.39 
 
 
216 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  37.07 
 
 
258 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  39.79 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  39.79 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  39.69 
 
 
225 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  37.76 
 
 
230 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  40.96 
 
 
237 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  35.2 
 
 
211 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  35.2 
 
 
211 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.56 
 
 
230 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  35.2 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.27 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  34.31 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  38.73 
 
 
229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  35.05 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 
216 aa  130  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  43.17 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  37.37 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  32.35 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  37.37 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  36.73 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  35.64 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  35.75 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.68 
 
 
242 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  39.41 
 
 
739 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  30.58 
 
 
233 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  33.97 
 
 
234 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  33.97 
 
 
239 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  34.29 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  37.88 
 
 
202 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  34.17 
 
 
272 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  33.97 
 
 
239 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  34.8 
 
 
242 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  35.23 
 
 
278 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  33.49 
 
 
239 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  33.81 
 
 
221 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 
236 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  39.27 
 
 
231 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  33.97 
 
 
239 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  37 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  35.75 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  35.75 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  35.75 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  35.75 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  35.75 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>