More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3592 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  82.63 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  78.95 
 
 		 214 aa  358  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  75.48 
 
 		 214 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  73.91 
 
 		 214 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  72.12 
 
 		 214 aa  327  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  67.44 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  53.55 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  52.63 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  52.63 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  53.59 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  49.04 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  56.04 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  49.04 
 
 		 213 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  49.04 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  52.2 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  56.1 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  48.33 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  48.54 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  48.06 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  44.65 
 
 		 218 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  48.34 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  43.87 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  46.01 
 
 		 255 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  38.5 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  44.79 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  41.59 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  42.44 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  42.58 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  42.59 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  40.09 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 213 aa  168  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  42.08 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  43.35 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 214 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  42.23 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  38.84 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  41.45 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  39.07 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  38.6 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  38.6 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  40.87 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  39.42 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  42.78 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  36.97 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 739 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  31.53 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  31.73 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  33.18 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  34.93 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  33.65 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  35.23 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  31.28 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  34.12 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  34.36 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  30.92 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  30.54 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  33.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  31.07 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  33.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  33.18 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  33.18 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  35.23 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  30.3 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  29.47 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  32.69 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  34.56 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  32.69 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  33.8 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  32.69 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  34.13 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>