More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0351 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  61.34 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  57.99 
 
 		 225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  57.99 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  50.72 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  52.11 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  50.23 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  50.95 
 
 		 213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  52.63 
 
 		 214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  51.67 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  49.29 
 
 		 213 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  50.71 
 
 		 214 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  50.47 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  51.66 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  50.48 
 
 		 214 aa  214  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  47.93 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  47.93 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  49.29 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  48.34 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  48.13 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  49.76 
 
 		 214 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  48.13 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  48.58 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  48.83 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  44.44 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  43.13 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  44.34 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  44.16 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  43.95 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  40.37 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  42.15 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  39.9 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  43.13 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  38.43 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  39.52 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  41.04 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  34.74 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  34.74 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  37.98 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  44.81 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  42.79 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  42.18 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.85 
 
 		 209 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.85 
 
 		 209 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  37.73 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.58 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.65 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  33.18 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  36.8 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  35.55 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  40.21 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  39.53 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  37.02 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.5 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  37.02 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  35.9 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  35.89 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  35.56 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  35.58 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  36.95 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  37.09 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  31.05 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  31.84 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  31.84 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  31.84 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  33.94 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  34.45 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  36.62 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  36.15 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  34.33 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  36.36 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  33.02 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  30.04 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  35.2 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  36.49 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  34.65 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  36.49 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  36.49 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  36.49 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  35.2 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  32.23 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  31.25 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  34.98 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  33.8 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  31.98 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  33.48 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  32.88 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  35.89 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>