More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1665 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  48.2 
 
 
218 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  43.93 
 
 
210 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  47.96 
 
 
214 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  43.95 
 
 
210 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  44.89 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  41.98 
 
 
214 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  46.86 
 
 
214 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  44 
 
 
244 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  37.09 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  37.09 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  41.51 
 
 
214 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  43.56 
 
 
211 aa  164  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  40.09 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  38.84 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  40.57 
 
 
214 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  38.68 
 
 
213 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  40.67 
 
 
216 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  40.48 
 
 
209 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  40.48 
 
 
209 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  37.79 
 
 
216 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  36.79 
 
 
214 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 
213 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  37.26 
 
 
215 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  35.81 
 
 
218 aa  151  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  41.59 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  36.97 
 
 
213 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  36.99 
 
 
213 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  38.89 
 
 
213 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  37.74 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  40.09 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  40.09 
 
 
255 aa  144  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  37.96 
 
 
241 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.1 
 
 
230 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  35.48 
 
 
225 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  40.4 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  37.04 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  38.76 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  38.76 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  38.94 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  34.86 
 
 
233 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  38.64 
 
 
224 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.58 
 
 
216 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  37.91 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  36.24 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  41.24 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  35.78 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.41 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  37.38 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  39.15 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  38.92 
 
 
214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  39.9 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  33.82 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  34.4 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  33.82 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  33.82 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  33.94 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  34.25 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  37.04 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  37.25 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  32.86 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  37.25 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  35 
 
 
230 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  34.55 
 
 
216 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  36.71 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  31.48 
 
 
207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  37.85 
 
 
209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  35.21 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  32.75 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  35.37 
 
 
787 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  32.84 
 
 
210 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  36.32 
 
 
218 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  33.92 
 
 
242 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  35.27 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  34.39 
 
 
229 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  34.56 
 
 
225 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  33.18 
 
 
267 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  33.18 
 
 
267 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  35 
 
 
222 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  33.48 
 
 
242 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  33.33 
 
 
272 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  33.63 
 
 
236 aa  121  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  36.62 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  36.62 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  36.62 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  37.1 
 
 
739 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  32.77 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  37.82 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  31.86 
 
 
213 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  34.85 
 
 
216 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  34.95 
 
 
231 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  36.15 
 
 
219 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  33.18 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  32.84 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  32.41 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  32.07 
 
 
248 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  28.64 
 
 
210 aa  115  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  32.3 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  32.3 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>