More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2705 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  72.56 
 
 		 222 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  72.56 
 
 		 214 aa  334  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  74.15 
 
 		 214 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  69.48 
 
 		 216 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  63.89 
 
 		 216 aa  299  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  56.74 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  47.57 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  46.67 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  43.06 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  45.45 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  41.98 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  42.58 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  43.33 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  45.28 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  42.59 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  44.55 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  44.34 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  44.6 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  43.06 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  39.17 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  41.79 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  41.43 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  41.23 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  38.79 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  39.53 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  38.79 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  41.06 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  39.52 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  43.5 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  45.95 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  42.64 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  42.64 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  45.11 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  41.92 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.99 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  42.39 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 225 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  38.61 
 
 		 225 aa  141  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  38.76 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.32 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  41.53 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  32.04 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  32.04 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  40.96 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  38.28 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  40.32 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  36.2 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  31.84 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  35.64 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  30.81 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  34.95 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  38.59 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  34.45 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  33.97 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  32.61 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  33.97 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  33.97 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  33.97 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  34.85 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  33.49 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  34.13 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  34.13 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  35.24 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  33.65 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  32.55 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  33.65 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  33.65 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.19 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  33.81 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  32.69 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  34.6 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  33.83 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  34.3 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  36.9 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  31.17 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  32.86 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  34.43 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  34.43 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  34.43 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  32.21 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  32.21 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  32.21 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  32.21 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  32.21 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  32.21 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  32.84 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  32.84 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  35.57 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  31.25 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  31.28 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>