More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0391 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  59.91 
 
 		 214 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  55.45 
 
 		 211 aa  234  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  54.03 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  54.76 
 
 		 210 aa  228  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  50.95 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  51.64 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  49.77 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  49.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  48.2 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  48.79 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  41.35 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  41.35 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  48.7 
 
 		 255 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  47.57 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  45.85 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  45.85 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  46.08 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  45.32 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  47.67 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  42.65 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  43.84 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  43 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  42.65 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  42.65 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  40.95 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  43.14 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  40.65 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  42.31 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  43.63 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  33.83 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 239 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 278 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  40.98 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  37.02 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  41.04 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  41.06 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  37.98 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.79 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.94 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.94 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.94 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.94 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.94 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.94 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  40 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  39.91 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  37.02 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.39 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  38.54 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  35.38 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  40.76 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 242 aa  147  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  40.74 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  36.79 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  41.21 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  41.21 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  35.58 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  35.58 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  37.68 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  37.2 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  38.21 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  41.45 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  41.45 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  39.11 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  40.2 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>