More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0231 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  89.1 
 
 		 214 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  88.57 
 
 		 214 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  75.71 
 
 		 214 aa  340  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  73.71 
 
 		 216 aa  340  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  73.91 
 
 		 220 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  71.01 
 
 		 216 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  58.25 
 
 		 225 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  58.69 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  51.44 
 
 		 213 aa  238  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  55.88 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  51.67 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  50.72 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  50.96 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  50.72 
 
 		 213 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  52.2 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  52.91 
 
 		 228 aa  226  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  51.2 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  50 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  51.67 
 
 		 241 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  46.38 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  47.69 
 
 		 242 aa  204  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  46.95 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  47.91 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  40.98 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  40.98 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  46.34 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  46.12 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  41.95 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  44.8 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  44.8 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  44.55 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  41.98 
 
 		 238 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  45.1 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  40.67 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  44.24 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  42.79 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  40.95 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  41.58 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  41.58 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  42.31 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  43.07 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.68 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  43.06 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  40.65 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  36.55 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  34.47 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  36.84 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  38.38 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  35.65 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  33.98 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  33.98 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  33.98 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  33.98 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  33.98 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  37.88 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  37.88 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  33.49 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  43.85 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  32.35 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 739 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  32 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  31.6 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  34.38 
 
 		 255 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  32.02 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  34.3 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  32.52 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  34.62 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  34.12 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  34.12 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  36.84 
 
 		 787 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  32.52 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  32.04 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  36.41 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  31.86 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  31.34 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  32.34 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  32.32 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>