More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1114 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  88.16 
 
 		 225 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  88.16 
 
 		 225 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  82.38 
 
 		 237 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  78.87 
 
 		 228 aa  340  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  70.22 
 
 		 230 aa  320  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  66.8 
 
 		 255 aa  320  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  43.72 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  43.06 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  41.06 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.58 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  39.41 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  44.06 
 
 		 787 aa  154  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.5 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  39.15 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  37.76 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  42.44 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  42.44 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  42.92 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  36.95 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  41.06 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40.76 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  40.72 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  41.46 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  40.57 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  39.41 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  39.81 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 		 210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  36.82 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  41.24 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  39.7 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  39.61 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  37.74 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  37.86 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  40.19 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  39.13 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  39.38 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  38.81 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  39.81 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  35.78 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  38.76 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  37.74 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  38.38 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  40.62 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  38.58 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  39.69 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 219 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 218 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  36.97 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  39.15 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  37.96 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  39.13 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  40.78 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  40.29 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  36.36 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  40.29 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  38.58 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.32 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  37.95 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  39.81 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  37.95 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  39.81 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  39.81 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  39.81 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  36.95 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  39.81 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  38.68 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  38.16 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  37.74 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  39.29 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  39.29 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>