More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0555 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  100 
 
 
210 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  58.49 
 
 
214 aa  254  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  57.77 
 
 
210 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  55.02 
 
 
214 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  56.8 
 
 
211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  54.9 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  54.9 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  50.95 
 
 
218 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  48.17 
 
 
230 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  47.91 
 
 
244 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  43.96 
 
 
228 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  43.96 
 
 
228 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  44.88 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  45.18 
 
 
221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  38.57 
 
 
206 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  38.57 
 
 
206 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  42.03 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  42.31 
 
 
213 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  43.59 
 
 
255 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  43.93 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  42.16 
 
 
225 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  40.2 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  44.33 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  41.06 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  42.86 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  43.35 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  37.91 
 
 
233 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.97 
 
 
207 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  39.71 
 
 
213 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  40.1 
 
 
216 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  41.38 
 
 
214 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  42.03 
 
 
213 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  39.05 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  37.26 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  37.26 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  39.81 
 
 
225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  38.42 
 
 
220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  37.26 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  40.28 
 
 
213 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  39.34 
 
 
215 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  38.92 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  37.44 
 
 
216 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  40.58 
 
 
214 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  37.98 
 
 
224 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  42.25 
 
 
218 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  40.28 
 
 
213 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  43.13 
 
 
241 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.59 
 
 
230 aa  158  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 
214 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  37.38 
 
 
210 aa  158  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.44 
 
 
214 aa  157  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  35.78 
 
 
227 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  34.3 
 
 
224 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
213 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  36.5 
 
 
200 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  37.13 
 
 
222 aa  156  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  39.41 
 
 
213 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  40 
 
 
209 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  39.9 
 
 
214 aa  154  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  34.8 
 
 
278 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  36.41 
 
 
242 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 
267 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 
267 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  35.92 
 
 
242 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  34.31 
 
 
272 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  33.5 
 
 
210 aa  151  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  36.41 
 
 
237 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  36.87 
 
 
228 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  34.95 
 
 
248 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  37.38 
 
 
239 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
239 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  35.58 
 
 
242 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  36.41 
 
 
239 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  36.41 
 
 
239 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  39.23 
 
 
225 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  37.8 
 
 
242 aa  148  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  34.5 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  36.68 
 
 
230 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  33.82 
 
 
236 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  36.22 
 
 
246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  37.26 
 
 
211 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  36.23 
 
 
221 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  34.95 
 
 
243 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 
258 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 
235 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  36.02 
 
 
234 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  40.66 
 
 
216 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  35.07 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  35.07 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  35.07 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  35.07 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  37.44 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  37.68 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  35.07 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  35.07 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  33.17 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  38.92 
 
 
216 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  36.32 
 
 
216 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  34.31 
 
 
225 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  34.31 
 
 
225 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>