More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3236 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  100 
 
 		 216 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  64.81 
 
 		 216 aa  307  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  67.48 
 
 		 214 aa  304  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  66.5 
 
 		 222 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  66.5 
 
 		 214 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  63.89 
 
 		 216 aa  299  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  54.93 
 
 		 216 aa  261  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  44.29 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  40.19 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  44.76 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  41.63 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  41.63 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  39.44 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  39.52 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  41.23 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  38.39 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  39.07 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  41.51 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  37.85 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40.74 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  38.32 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  40.72 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  33.66 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  37.96 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  40.44 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  37.68 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  40.4 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  39.39 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  40.54 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  40.98 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  37.62 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  36.97 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  36.19 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  39.32 
 
 		 244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  41.94 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  38.25 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  32.86 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  33.97 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  35.03 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  37.16 
 
 		 185 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  34.76 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  33.01 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  32.37 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  32.37 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  35.71 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  32.23 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  32.54 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  30.32 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  34.62 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  32.61 
 
 		 356 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  32.38 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  31.91 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  32.82 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  32.82 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  31.75 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  29.52 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  28.99 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  32.18 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  36.06 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  36.06 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  33.5 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  31.55 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  31.63 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  32.81 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  29.85 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  32.65 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  32.8 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  29.85 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  29.85 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  29.85 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  29.85 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  34.91 
 
 		 787 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  31.22 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  29.85 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  29.85 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>