More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1920 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  69.57 
 
 		 213 aa  299  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  60.78 
 
 		 210 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  50 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  47.32 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  46.34 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  46.31 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  45.81 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  44.76 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  47.8 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  44.88 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  44.86 
 
 		 255 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  46.34 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  41.35 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  42.58 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  45.85 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  44.19 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  45.37 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  45.89 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  44.55 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  40.95 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  42.65 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  40.87 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  41.83 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40.65 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  44.29 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  37.98 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  42.72 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  40.28 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  43.37 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  40.38 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  40.85 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  42.25 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  40.85 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  40.85 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  38.21 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  39.09 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  39.09 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  41.94 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  38.64 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  30.2 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  34.76 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  38.25 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.51 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  36.2 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  36.24 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  33.81 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  36.19 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  36.24 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  32.08 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.62 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.38 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  35.55 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  36.71 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  30.48 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  32.52 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  34.31 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  34.36 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  31.58 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  35.78 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  35.78 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  35.78 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  35.78 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  32.37 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  31.88 
 
 		 267 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  31.88 
 
 		 267 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  35.29 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  34.27 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  36.06 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  32.58 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  35.29 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  29.81 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  28.37 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  31.28 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  28.37 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  33.96 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  28.37 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  30.88 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  32.68 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  34.8 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  27.4 
 
 		 356 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  34.3 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  32.72 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  34.31 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  32.69 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  34.3 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  34.3 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  33.17 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  32.21 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  32.2 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  31.48 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>