More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2731 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  89.95 
 
 		 219 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  93.27 
 
 		 239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  77.31 
 
 		 220 aa  351  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  75.93 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  72.9 
 
 		 219 aa  342  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  74.76 
 
 		 211 aa  338  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  71.83 
 
 		 219 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  71.83 
 
 		 223 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  69.48 
 
 		 219 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  67.14 
 
 		 217 aa  324  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  69.01 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  69.01 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  69.01 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  67.44 
 
 		 219 aa  317  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  67.44 
 
 		 219 aa  317  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  67.44 
 
 		 219 aa  317  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  67.44 
 
 		 219 aa  317  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  67.44 
 
 		 219 aa  317  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  67.44 
 
 		 219 aa  317  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  69.19 
 
 		 219 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  69.63 
 
 		 219 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  66.98 
 
 		 219 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  68.37 
 
 		 219 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  66.98 
 
 		 219 aa  314  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  70.62 
 
 		 211 aa  314  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  69.16 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  69.16 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  69.16 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  69.16 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  69.16 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  71.57 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  69.19 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  66.99 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  66.02 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  66.99 
 
 		 211 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  64.49 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  53.43 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  51.85 
 
 		 221 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  52.94 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  50.93 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  54.68 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  52.45 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  52.45 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  51.63 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  53.05 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  52.07 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  51.16 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  56.57 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  53.24 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  53.4 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  51.17 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  50.91 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  49.54 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  49.1 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  49.77 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  46.04 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  45.93 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  48.73 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  49.02 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  46.83 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  44.61 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  44.06 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  44.27 
 
 		 272 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  41.29 
 
 		 356 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  41.09 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  43.07 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  41.87 
 
 		 284 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  51.57 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  41.75 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 200 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  37.68 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  37.68 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  37.68 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  37.8 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  42.36 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  42.79 
 
 		 749 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  38.24 
 
 		 754 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  42.6 
 
 		 877 aa  138  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  42.11 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.38 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  35.1 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  40.91 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  39.49 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  35.96 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  41.05 
 
 		 787 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  38.66 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  40.1 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>