More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2660 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  100 
 
 
213 aa  447  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  53.43 
 
 
207 aa  238  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  47.62 
 
 
214 aa  229  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  48.53 
 
 
211 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  48.53 
 
 
211 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  48.53 
 
 
211 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  47.55 
 
 
213 aa  221  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  48.54 
 
 
222 aa  221  7e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  48.1 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  49.24 
 
 
200 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  45.1 
 
 
210 aa  207  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  40.76 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  41.26 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  41.83 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  39.71 
 
 
210 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  41.83 
 
 
221 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  44.55 
 
 
278 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  41.58 
 
 
267 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  41.58 
 
 
267 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  45.69 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  42.52 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  44.12 
 
 
356 aa  164  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.19 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  40.19 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  39.11 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  44.02 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  40.95 
 
 
243 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  41.67 
 
 
230 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  40.19 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  40.39 
 
 
248 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  44.61 
 
 
230 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  40.38 
 
 
239 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 
235 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  39.02 
 
 
258 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  38.94 
 
 
225 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  39.59 
 
 
251 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  39.9 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  39.9 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  41.51 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  43 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  40.4 
 
 
284 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
210 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  39.9 
 
 
239 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  39.52 
 
 
216 aa  154  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  40.65 
 
 
225 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  39.9 
 
 
236 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  38.16 
 
 
244 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  39.71 
 
 
227 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  37.14 
 
 
230 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
272 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  37.13 
 
 
214 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  42.92 
 
 
230 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  39.9 
 
 
216 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  39.34 
 
 
233 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  38.65 
 
 
207 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  40 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  37.13 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  42.71 
 
 
787 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  36.73 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  42.35 
 
 
227 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  37.76 
 
 
229 aa  144  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  40.28 
 
 
225 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  36.63 
 
 
211 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  37.86 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  40.28 
 
 
225 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  37.02 
 
 
225 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
211 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  32.68 
 
 
209 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  32.68 
 
 
209 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
211 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  38.89 
 
 
255 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  38.31 
 
 
213 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  39.51 
 
 
754 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  36.63 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  38.86 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  36.36 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  34.65 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  34.65 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  34.65 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  34.65 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  34.65 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  34.65 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
228 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  36.89 
 
 
228 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  40 
 
 
219 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  35.26 
 
 
209 aa  138  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  37.25 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  34.83 
 
 
221 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  34.16 
 
 
219 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  35.75 
 
 
213 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  37 
 
 
220 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  38.05 
 
 
220 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>