More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1824 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  47.69 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  49.74 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  44.56 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  45.08 
 
 		 194 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  42.64 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  44.04 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  40.8 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  42.56 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  42.56 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  42.56 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  36.68 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  36.18 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.69 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  35.9 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  35.9 
 
 		 251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  35.18 
 
 		 239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  35.68 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  35.5 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  35.82 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  35.21 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  34.67 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  40.7 
 
 		 739 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  34.87 
 
 		 235 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  34.67 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 225 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  34.83 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  33.17 
 
 		 356 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  35.32 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  35.86 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  35.03 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  36.04 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  34.34 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  33.83 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  34.63 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  34.85 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  34.85 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  35.35 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  34.85 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  34.85 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  34.85 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  34.85 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  34.85 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  34.34 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  33.84 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  33.66 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  33.67 
 
 		 225 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  32.5 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  36.7 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  35.29 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  33.99 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  35.29 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  33.5 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  32.83 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  34.85 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  32.83 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  32.83 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  35.45 
 
 		 877 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 242 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  35.27 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  32.84 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  34.8 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  33.66 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  32.16 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  32.32 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  33.83 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  33.84 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  34.34 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  34.69 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  32.32 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  35.12 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  36.07 
 
 		 787 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  31 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  31.53 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  34.2 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  34.52 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  34.5 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  33.82 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  33 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  31 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  31 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  31.31 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  31.19 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  33.68 
 
 		 230 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  33.02 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  31.22 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  31.82 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  31.82 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  32.68 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  32.06 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>