More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2001 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  86.15 
 
 		 211 aa  357  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  78.68 
 
 		 215 aa  337  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3955  Carbonate dehydratase  86.08 
 
 		 195 aa  333  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000782852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3868  carbonic anhydrase  85.57 
 
 		 200 aa  332  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  79.58 
 
 		 196 aa  329  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  73.2 
 
 		 201 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  49.22 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0986  carbonate dehydratase  48.17 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0207878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0316  carbonate dehydratase  43.3 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  41.4 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  42.33 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  39.47 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  38 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  38.5 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  41.8 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1824  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000671505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  38.5 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  38.5 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  38.5 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  36.92 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  37.84 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  36.63 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  38.22 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  39.34 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  38.3 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  38.83 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  39.58 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  39.58 
 
 		 291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  36.98 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  39.58 
 
 		 310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  38.14 
 
 		 211 aa  131  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  35.08 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  34.55 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  37.31 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  34.65 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  37.76 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  35.08 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  35.75 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  36.6 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  39.06 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  35.53 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  35.53 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  36.7 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  37.17 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  36.5 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  36.13 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  36.13 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  36.13 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  36.13 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  36.13 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  33.5 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  36.13 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  36.13 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  37.7 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  35.2 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  36.98 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  37 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  36.7 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  36.7 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  37.7 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  35.08 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  34.55 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  34.9 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  33.96 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  37.11 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  36.46 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  36.46 
 
 		 267 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  33 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  35.6 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  35.57 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  35.57 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  35.57 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>