More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1508 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  59.38 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  57.65 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  57.65 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  57.81 
 
 		 211 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  57.65 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  57.65 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  57.65 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  57.65 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  54.11 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  57.81 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  54.11 
 
 		 211 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  52.34 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5585  carbonate dehydratase  53.55 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691086  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1646  carbonate dehydratase  56.02 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2257  carbonate dehydratase  56.02 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2281  carbonate dehydratase  56.02 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.710265  normal  0.440808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2296  carbonate dehydratase  56.02 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2174  carbonate dehydratase  56.02 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1020  carbonate dehydratase  57.3 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.870434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  47.47 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  48.97 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  48.97 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  44.28 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  47.94 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  47.94 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  46.5 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  47.87 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  43.81 
 
 		 196 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  43.81 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2100  carbonate dehydratase  42.6 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.54932  normal  0.632203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  46.28 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  45.79 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  46.28 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  46.28 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  46.28 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  46.28 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  46.28 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  43.96 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  43.28 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  45.26 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  43.33 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  44.16 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  43.65 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  47.37 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  43.3 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  43.3 
 
 		 310 aa  158  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  43.3 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  43.3 
 
 		 291 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  40.51 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  43.9 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  39.6 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  42.27 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  43.81 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  44.1 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  42.86 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  46.2 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  42.78 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  42.63 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  43.81 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  42.78 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1417  carbonate dehydratase  43.08 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  44.15 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  42.27 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  42.27 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  42.27 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  42.27 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  42.78 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  42 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  41.24 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  40 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  42.78 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  40.09 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0412  Carbonate dehydratase  42.21 
 
 		 220 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  40.51 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  39.49 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  40.38 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  40.41 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1138  Carbonate dehydratase  42.27 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.580584  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  40.31 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  41.75 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  40.72 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  37 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  41.8 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  43.01 
 
 		 380 aa  147  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  40.21 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  41.62 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>