More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4665 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  56.13 
 
 		 214 aa  248  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  56.08 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  53.65 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  53.17 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  56.25 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  53.88 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  55.73 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  52.15 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  51.67 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  50.24 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  55.21 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  55.21 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  55.73 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  53.65 
 
 		 212 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  53.89 
 
 		 209 aa  227  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  52.08 
 
 		 217 aa  227  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  55.21 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  54.69 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  53.65 
 
 		 220 aa  224  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 205 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  54.69 
 
 		 201 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  54.69 
 
 		 201 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  54.92 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 204 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  53.65 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  54.17 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  53.12 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  54.69 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  53.65 
 
 		 387 aa  222  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  50.49 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  52.6 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  49.76 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  53.65 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  52.63 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  49.29 
 
 		 215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  52.11 
 
 		 258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  51.56 
 
 		 258 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  50.26 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  53.76 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  51.58 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  51.58 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  51.04 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  51.58 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  51.87 
 
 		 380 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  54.4 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  53.44 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  51.05 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  50 
 
 		 261 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  50 
 
 		 256 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  50.26 
 
 		 256 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  50.27 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  53.89 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  47.83 
 
 		 310 aa  214  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  49.47 
 
 		 207 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  47.83 
 
 		 291 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  53.12 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  50.52 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  47.83 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  54.4 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  50 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  50.53 
 
 		 250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  51.58 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  50.52 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  51.83 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  51.24 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  50.78 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  50.53 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  49.47 
 
 		 264 aa  207  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.600285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>