More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3997 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  100 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  86.32 
 
 		 213 aa  387  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  85.85 
 
 		 213 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  85.38 
 
 		 213 aa  380  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  85.85 
 
 		 212 aa  380  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  81.86 
 
 		 310 aa  370  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  81.86 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  81.86 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  81.22 
 
 		 220 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  80.75 
 
 		 220 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  80.75 
 
 		 220 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  79.81 
 
 		 220 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  78.04 
 
 		 220 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  79.81 
 
 		 220 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  79.81 
 
 		 220 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  79.81 
 
 		 220 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  78.87 
 
 		 220 aa  357  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  67.45 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  65.09 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  65.57 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  67.92 
 
 		 219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  64.62 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  55.87 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  56.13 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  56.52 
 
 		 212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  56.04 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  57.65 
 
 		 201 aa  254  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  56.72 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  57.36 
 
 		 203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  56.22 
 
 		 201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  57.95 
 
 		 201 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  56.22 
 
 		 205 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  56.22 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  56.22 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  53.59 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  55.78 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  56.22 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  54.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  56.22 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  51.21 
 
 		 220 aa  248  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3778  carbonate dehydratase  51.44 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  50.71 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  57.71 
 
 		 203 aa  247  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  57.73 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  56.44 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  55.73 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  55.33 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  51.44 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  54.73 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  51.71 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  56.78 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  55.5 
 
 		 196 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  53.62 
 
 		 215 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  53.62 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  52.48 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  53.4 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  50.48 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  51.42 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  50.48 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  51.94 
 
 		 380 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4189  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  53.11 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  49.29 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  52.38 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  50.24 
 
 		 387 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  49.77 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  52.24 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  53.77 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  50.72 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  53.23 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  52.17 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  53.77 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  53.57 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  50.95 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  50.48 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  49.08 
 
 		 220 aa  234  8e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  50.95 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  50.72 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  50 
 
 		 255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  50.49 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  50.69 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  50.23 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  49.77 
 
 		 250 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  47.96 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  50.48 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>