More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4189 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4189  carbonate dehydratase  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  75.8 
 
 		 255 aa  349  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  75.12 
 
 		 223 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  67.63 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  64.49 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  65.57 
 
 		 220 aa  293  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  64.59 
 
 		 220 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3778  carbonate dehydratase  64.59 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  62.33 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  59.53 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  55 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  59.91 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  60.95 
 
 		 258 aa  269  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  58.41 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  57.62 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  59.52 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  61.84 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  61.84 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  61.84 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  61.35 
 
 		 256 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  60.87 
 
 		 250 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  58.17 
 
 		 380 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  61.35 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  58.65 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  60.39 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  57.42 
 
 		 387 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  59.91 
 
 		 221 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  52.63 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  52.15 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  60.39 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  58.33 
 
 		 223 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  57.41 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  58.1 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  60.39 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  51.67 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  52.66 
 
 		 213 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  57.14 
 
 		 226 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  52.4 
 
 		 213 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  51.67 
 
 		 220 aa  254  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  55.24 
 
 		 220 aa  254  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  56.67 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  55.84 
 
 		 204 aa  248  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  55.5 
 
 		 217 aa  248  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  57.42 
 
 		 219 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  57.81 
 
 		 203 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  57.51 
 
 		 201 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  55.45 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  56.12 
 
 		 203 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  50.48 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  54.55 
 
 		 201 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  54.46 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  54.5 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  47.66 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  50.72 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  47.66 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  54.55 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  55.05 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  54.69 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  49.51 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  55.96 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  55.96 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  53.03 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  55.96 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  53.06 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  56.25 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  55.96 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  49.03 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  49.03 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  49.03 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  49.03 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  54.59 
 
 		 204 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  55.15 
 
 		 203 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  48.54 
 
 		 220 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  53.77 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  50.97 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  50.97 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  46.3 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  48.1 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  50.97 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  51.53 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00754  carbonic anhydrase  53.55 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.226813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  50.98 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  48.78 
 
 		 212 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  46.23 
 
 		 222 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  48.08 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  48.29 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  48.04 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>