More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3268 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  56.41 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1138  Carbonate dehydratase  55.28 
 
 		 218 aa  251  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.580584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  57.14 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  54.92 
 
 		 264 aa  242  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  48.79 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  48.74 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  46.63 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  47.03 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  50.26 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  43.78 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  47.85 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  48.22 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  48.48 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  48.48 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  48.48 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  48.98 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  46.97 
 
 		 203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  47.18 
 
 		 199 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  48.98 
 
 		 201 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  46.5 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  44.71 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  48.98 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  47.96 
 
 		 201 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  46.94 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  46.08 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  46.94 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  46.43 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  45.89 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  43.14 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  46.43 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  46.12 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  46.27 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  46.43 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  46.43 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  43.72 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  46.43 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  46.91 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  47.37 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  45.41 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  45.5 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  46.43 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  46.91 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  47.12 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  45.64 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  46.7 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  44.44 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  44.44 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  47.94 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  44.44 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  43.96 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  43.52 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  45.7 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  43.78 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  47.89 
 
 		 387 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  45.13 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  48.15 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  43.75 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 255 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  42.11 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  48.24 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4189  carbonate dehydratase  43.35 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  42.64 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  42.79 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 380 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  43.2 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  45.13 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  42.79 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  41.06 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  48.24 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  44.02 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  43.2 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  45.5 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  41.35 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>