More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1442 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  56.13 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  54.85 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  52.5 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  51.03 
 
 		 213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  51.03 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  50 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  48.28 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  49.28 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  51.94 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  50.52 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  50.52 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  50.52 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  50.52 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  46.83 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  50.52 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  50.25 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  49.48 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  48.1 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  48.77 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  51.55 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  52.33 
 
 		 387 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  46.31 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  51.01 
 
 		 380 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  49.48 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  46.41 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  50.77 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  48.97 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  48.97 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  46.91 
 
 		 310 aa  205  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  46.91 
 
 		 291 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  46.91 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  48.45 
 
 		 203 aa  204  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  49.21 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  49.48 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  49.74 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  45.45 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  45.85 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  48.45 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  48.97 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  48.97 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  45.45 
 
 		 215 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  46.48 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  48.91 
 
 		 207 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  48.97 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  47.57 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  48.69 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  47.94 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  43.33 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  47.15 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  46.01 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  46.01 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  45.45 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  48.69 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  47.94 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  45.45 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  48.45 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  45.89 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  47.94 
 
 		 196 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  46.6 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  43.54 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  47.15 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  45.59 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  46.88 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  48.51 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  45.88 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  47.42 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  45.6 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  44.17 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  46.91 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  48.17 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  47.64 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>