More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0643 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 223 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  57.56 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  60.89 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  57.87 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  56.57 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  56.57 
 
 		 206 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  56.06 
 
 		 201 aa  247  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  55.5 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  55.39 
 
 		 209 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  55.56 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  56.25 
 
 		 203 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  57.29 
 
 		 204 aa  244  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  53.96 
 
 		 221 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  56.92 
 
 		 201 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  55.44 
 
 		 205 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  55.44 
 
 		 205 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  56.77 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  52.2 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  52.74 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  55.96 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  53.27 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  54.92 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  56.02 
 
 		 203 aa  238  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  54.92 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  55.85 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  55.44 
 
 		 199 aa  235  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  53.93 
 
 		 204 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  55.96 
 
 		 196 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  53.96 
 
 		 380 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  52.55 
 
 		 223 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  50.73 
 
 		 212 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  53.73 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  50.98 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  50.98 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  53.57 
 
 		 223 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  49.76 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  48.29 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  54.17 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  51.71 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  50.24 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  50.48 
 
 		 261 aa  225  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  47.78 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  50.73 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  49.52 
 
 		 387 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  53.19 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011546 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  48.57 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  50.75 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  51.74 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  51.24 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  46.34 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  51.24 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  51.24 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  47.67 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  50.51 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  50.75 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  45.85 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  46.31 
 
 		 213 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  49.02 
 
 		 213 aa  218  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  53.97 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  46.31 
 
 		 213 aa  218  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  50.25 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  53.76 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  48.99 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  48.33 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  45.81 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  46.8 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  49.28 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  50.52 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  47.17 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  48.77 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3778  carbonate dehydratase  51.02 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  51.02 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  48.28 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  47.92 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  47.06 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  50.25 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  48.29 
 
 		 219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  46.31 
 
 		 310 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  47.06 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  46.57 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  46.31 
 
 		 291 aa  211  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  44.29 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  48.21 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>